No dia do acidente, ele estava dirigindo um Volkswagen Gol em direção a Jateí. Segundo o MS News, em determinado momento, Jeferson perdeu o controle do veículo e colidiu com um Chevrolet Onix ocupado por uma família de Campo Grande (MS).
Os socorristas do Corpo de Bombeiros foram acionados para acionar a ocorrência, entretanto, ao chegarem no local encontraram Jeferson Ishibasi, gravemente ferido, ele chegou a ser socorrido com vida e encaminhado para uma unidade de saúde de Vicentina, contudo, por causa das lesões incompatíveis com a vida, ele evoluiu para o óbito. Veja a seguir a foto do acidente.